Table 1.

Primers Used in This Study

NameSequence 5′ to 3′
−549E9-for5′-GGAAGTCAGACAATAAGAATTCAATGAAATAGCAGG-3′
−523E9-for5′-GGCCTTTAAGAATTCTTTAGACCAAGCTTATGG-3′
−411E11EcoRI-for5′-AATAAAGAATTCGACATTAAATTTGAGGG-3′
411E11XbaI-for5′-TAAAAATCTAGACACTTAAATTTGAGG-3′
−411E11ΔGC-for5′-GAGGGTCATAATAACATAAAATAAT*AAAGCTATTATTTTACCAGCC-3′
−411E11ΔGC-rev5′-GGCTGGTAAAATAATAGCTTT*ATTATTTTATGTTATTATGACCCTC-3′
−411E11ΔGAT-for5′-GGCCAGTGAATTCGACACTTA*ATAATAACATAAAATAATTGCAG-3′
−411E11ΔGAT-rev5′-CTGCAATTATTTTATGTTATTAT*TAAGTGTCGAATTCACTGGCC-3′
−411E11dledel-for5′-GATTAATAAAAGAATTCGACACTTA*ATAATAACATAAAATAATAAAGC-3′
−411E11dbledel-rev5′-GCTTTATTATTTTATGTTATTAT*TAAGTGTCGAATTCTTTATTAATC-3′
−392E11EcoRI-for5′-TGGAATTCATAATAACATAAAATAATTG-3′
−392E11XbaI-for5′-TGTCTAGAATAATAACATAAAATAATTG-3′
−380E11NheI-rev5′-CTGCAAGCTAGCTATGTTATTATGACC-3′
−380E11HindIII-rev5′-CTGCAAAAGCTTTATGTTATTATGACC-3′
−367E11mutDOF-for5′-AGGCCTGCGACTATTATTTTACC-3′
−367E11mutGC-for5′-CATATGTAAAGCTATTATTTTACC-3′
−367E11mutGC-rev5′-CATATGCAATTATTTTATGTTATTATGAC-3′
−367E11mutHDZ-rev5′-AGGCCTGCACTTAGTTTATGTTATTATGAC-3′
−358E11HindIII-rev5′-GGCTGGTAAAATAAAAGCTTTAGGCC-3′
−358E11NheI-rev5′-GGCTGGTAAAATGCTAGCTTTAGG-3′
−350E11-for5′-GGTACCAGCCTTTTAATTTGACC-3′
−257E11-rev5′-GGAATCTAGATTCTTGGC-3′
−257E11-rev5′-GGAATCTAGATTCTTGGC-3′
−0E11-rev5′-TGCCCACAGGCCGTCGAG-3′
ERN1-for5′-GGAAGATGGTGCTGTTGCTT-3′
ERN1-rev5′-TGTTGGATTGTGAACCTGACTC-3′
ERN2-for5′-ATGATTCCCCTCTCGCTTCT-3′
ERN2-rev5′-CACTGGCTGTGCCAATACAG-3′
ERN3-for5′-TGGCCATTACCTCAACAAAGG-3′
ERN3-rev5′-CCTTCCACATAGCACTCATTCA-3′
ERN1delAP2-for5′-CACTCGAACCAGAATTCTCACTCATG-3′
ERN1delAP2-rev5′-GCCTTTGCCGAATTCCAACAAAC-3′
ERN2delAP2-for5′-CTCGTACCAGAATTCTCACACATG-3′
ERN2delAP2-rev5′-CTTTGTCTCAGAATTCCAAACTTGTCTC-3′
ERN3delAP2-for5′-TACTCGTAGAATTCTCTCTACTACTC-3′
ERN3delAP2-rev5′-GCTCTTTGTCGAATTCCAACAAAC-3′
  • Nucleotides in boldface correspond to substitutions in order to generate new restriction sites (underlined).